Functional implication of gwas candidate genes in celiac disease pathogenesis

Abstract

La enfermedad celíaca (EC) es una enfermedad autoinmune que se desarrolla en personas con susceptibilidad genética. En los últimos años se han realizado diversos estudios de asociación genómica, en los que se han identificado nuevas regiones asociadas a EC y se han propuesto una larga lista de genes candidato.Los objetivos de esta tesis han sido, por un lado repetir los estudios de asociación en población española y por otro lado hacer un estudio funcional de los genes candidato propuestos.Debido a las diferencias genéticas entre poblaciones, no todas las regiones genéticas aparecen asociadas en cada una de las poblaciones a estudio. En el caso de la población española, hemos obtenido resultados variados. Algunas de las regiones aparecen asociadas y otras no, y además hemos sido capaces de identificar nuevas regiones asociadas en nuestra población.Para el estudio funcional de los genes candidato, hemos analizado la expresión de dichos genes en varios tipos de muestras. Por un lado biopsias intestinales de pacientes celiacos al diagnóstico y tras el tratamiento, y controles no celíacos; y por otro lado poblaciones celulares extraídas de las biopsias de dichos pacientes, con el objetivo de analizar con mayor precisión lo que ocurre en cada uno de los tipos celulares.Los resultados obtenidos demuestran una vez más la complejidad de la EC, ya que la relación entre los genes alterados y los SNPs asociados no es directa