Predicción de la estructura secundaria de las proteínas mediante redes neuronales

Abstract

El trabajo está organizado como sigue: en el primer capítulo se realiza una introducción en el ámbito de la bioquímica para conocer el origen de las proteínas a partir del ADN y la secuenciación de aminoácidos. Además, se destacarán las diferentes estructuras secundarias de las proteínas ya que el objetivo del trabajo se fundamenta en la predicción de éstas. A continuación, en el capítulo 2 se introducirán las técnicas de Soft Computing, mencionando las más empleadas actualmente y haciendo especial hincapié en las Redes Neuronales, las cuales serán utilizadas para la resolución del trabajo. En el capítulo 3 comienza el desarrollo del procedimiento seguido: en primer lugar se realiza un análisis de la base de datos y herramienta de programación utilizadas. Posteriormente se comienza con la manipulación de datos y la formación de las muestras tanto de entrada como de salida. Como se podrá comprobar ulteriormente, se han hecho uso de tres esquemas de codificación para la obtención de datos (esquema ortogonal, estadístico y mediante grafos dirigidos). Para concluir con el capítulo, se desarrollan las decisiones tomadas respecto a la topología de la red neuronal, y así en el capítulo 4 analizar y discutir los resultados obtenidos en las diferentes redes neuronales. Además se realiza una clasificación de los resultados más significativos con intención de mejorar dichos resultados. Finalmente, se efectúan una serie de conclusiones de cierre en las que se incorporan futuras líneas de seguimiento para la máxima optimización del problema.