Application of panel-based next-generation sequencing (NGS) tools to improve the diagnosis and treatment of pediatric patients diagnosed with sarcomas and to identify hereditary cancer predisposition

Abstract

Los sarcomas son un grupo heterogéneo de tumores malignos de origen mesenquimal que representan aproximadamente el 20% de los tumores pediátricos. Existen más de 100 subtipos y el diagnóstico diferencial es complejo. El objetivo principal de este estudio fue caracterizar las muestras biológicas tumorales de pacientes pediátricos diagnosticados de sarcomas mediante paneles basados en NGS (del inglés Next-generation sequecing) para la identificación de marcadores moleculares de valor clínico y analizar el potencial de estos estudios en tejido somático para identificar variantes patogénicas en línea germinal. Mediante la secuenciación se identificaron alteraciones genéticas con potencial implicación clínica en el 74% de los pacientes. Siendo la detección de genes de fusión uno de los eventos con más relevancia clínica debido a su valor diagnóstico en los sarcomas. La revisión de los resultados de la secuenciación tumoral permitió la identificación de variantes patogénicas en línea germinal en el 8.5% de los pacientes diagnosticados de sarcomas de la cohorte. Además, se identificaron dos pacientes con variantes patogénicas en APC asociadas a síndrome de Gardner. Los estudios de NGS son una herramienta útil para un diagnóstico más preciso de los pacientes pediátricos diagnosticados de sarcomas, lo que permite la mejora en el manejo clínico de estos pacientes. La identificación de síndromes de predisposición hereditaria al cáncer permite ajustar mejor el seguimiento de los pacientes a su riesgo real e identificar a otros familiares que pueden beneficiarse de las pruebas predictivas cuando aún no han desarrollado un tumor